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【中国科学报】迄今最高分辨率“野生稻-栽培稻泛基因组图谱”问世

2025-04-18 中国科学报 江庆龄
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澳门赌场分子植物科学卓越创新中心韩斌院士、赵强研究员团队,首次完成了145份亚洲栽培稻及普通野生稻的高精度基因组组装,绘制了迄今分辨率最高的“野生稻-栽培稻泛基因组图谱”,系统挖掘了普通野生稻广泛的遗传多样性,全面解析了亚洲栽培稻各类群的进化及驯化路线,为水稻基因组辅助育种提供了前所未有的遗传资源,也为培育抗病耐逆、适应气候变化的优质水稻品种奠定了坚实的科学基础。4月16日,相关研究发表于《自然》。

面对全球人口增长和气候变化加剧的双重压力,如何将野生稻历经万年锤炼的“生存智慧”注入现代品种,培育出兼具高产潜力与抗病抗逆特性的“超级水稻”,已成为破解粮食安全困局的重大课题。然而,依赖单一参考基因组的传统研究模式仅能捕捉水稻遗传多样性的冰山一角。目前急需构建一个高质量、大规模的野生稻泛基因组,深度解析其广泛的多样性,全面挖掘其耐逆、抗病等优良性状。

研究团队整合具有代表性的129份普通野生稻和16份亚洲栽培稻资源,进行高质量的基因组测序和从头组装,构建了一个可以覆盖野生稻和栽培稻全面遗传景观的泛基因组图谱。

研究团队表示,这一参考基因组级别的栽培稻-野生稻泛基因组在原有公认的单个参考基因组的基础上新增了38.7亿个碱基对,包含69531个基因,其中近20%为野生稻特有,这些基因被证实与抗病防御、环境适应性等性状密切相关。

基因组分析结果发现,野生稻中的抗病基因丰度和多样性均明显高于栽培稻,已精准定位到1184个野生稻中拷贝数高于栽培稻的抗病基因位点,其中包含两个已验证的抗稻瘟病基因。这些发现进一步证实了野生稻堪称作物改良的“战略资源库”,可以为培育抗病耐逆的水稻品种提供直接的基因来源。

研究团队进一步证明了所有亚洲栽培稻的驯化位点均来源于粳稻祖先Or-Ⅲa,为亚洲栽培稻单起源假说提供了关键证据。团队同时发现,南亚各栽培稻类群之间存在广泛的基因交流,并由此定义了一个新的栽培稻亚群intro-indica,绘制了一幅全面的水稻进化和驯化路线图。

相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41586-025-08883-6

(原载于《中国科学报》?2025-04-18?第1版?要闻)

打印 责任编辑:闫文艺

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